CBX5

CBX5
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3FDT, 3I3C

識別子
記号CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5
外部IDOMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCards: CBX5
遺伝子の位置 (ヒト)
12番染色体 (ヒト)
染色体12番染色体 (ヒト)[1]
12番染色体 (ヒト)
CBX5遺伝子の位置
CBX5遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点54,230,942 bp[1]
終点54,280,133 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
15番染色体 (マウス)
染色体15番染色体 (マウス)[2]
15番染色体 (マウス)
CBX5遺伝子の位置
CBX5遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点103,099,971 bp[2]
終点103,148,243 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能• protein homodimerization activity
• 血漿タンパク結合
• protein-macromolecule adaptor activity
• クロマチン結合
• ヒストンデアセチラーゼ結合
• methylated histone binding
• ribonucleoprotein complex binding
• protein-containing complex binding
• identical protein binding
細胞の構成要素• 動原体
• 細胞核
• nuclear envelope
• pericentric heterochromatin
• 核小体
• histone deacetylase complex
• 核質
• chromocenter
• ヘテロクロマチン
• セントロメア
• histone methyltransferase complex
• transcription repressor complex
• 染色体
• PML body
• 高分子複合体
• リボ核タンパク質
• site of DNA damage
生物学的プロセス• 凝固・線溶系
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• viral process
• negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• negative regulation of G0 to G1 transition
• cellular response to DNA damage stimulus
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

23468

12419

Ensembl

ENSG00000094916

ENSMUSG00000009575

UniProt

P45973

Q61686

RefSeq
(mRNA)

NM_012117
NM_001127321
NM_001127322

NM_001076789
NM_001110216
NM_007626
NM_001358950

RefSeq
(タンパク質)

NP_001120793
NP_001120794
NP_036249

NP_001070257
NP_001103686
NP_031652
NP_001345879

場所
(UCSC)		Chr 12: 54.23 – 54.28 MbChr 12: 103.1 – 103.15 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

CBX5（chromobox 5）またはHP1α（heterochromatin protein 1 alpha）は、ヒトではCBX5遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6]。高度に保存されており、ヘテロクロマチン形成に関与する構成する非ヒストンタンパク質ファミリーの1つである、HP1ファミリーに属する。HP1のN末端にはクロモドメインが存在し、メチル化されたリジンに対して作用してエピジェネティックな抑制をもたらす[7]。C末端領域にはクロモシャドウドメイン（英語版）が存在し、ホモ二量体化やさまざまなクロマチン関連非ヒストンタンパク質との相互作用を担う[8]。

構造

HP1αは191アミノ酸から構成される[7][8]。上述したように、このタンパク質には、N末端のクロモドメイン（CD）とC末端のクロモシャドウドメイン（CSD）の2つのドメインが存在する。CDはメチル化されたヒストンH3リジン9番残基（H3K9）に結合する。CSDはホモ二量体化し、他のさまざまなクロマチン関連非ヒストンタンパク質と相互作用する[8]。この2つのドメインはヒンジ領域で連結されている[9]。

クロモドメイン

クロモドメインは、3本のストランドのβシートと1本のαヘリックスからなる球状のコンフォメーションをとる。βシートはC末端側に位置するαヘリックスに対してパッキングする[9]。CDのメチル化H3K9への特異的結合は、"hydrophobic box"と呼ばれる3つの疎水性側鎖によって媒介されている。HP1上のその他の部位はH3のN末端テールと相互作用し、柔軟なテール領域は一定の構造をとるようになる。テールの隣接領域の翻訳後修飾によってHP1の結合に影響が生じる場合がある[9]。

クロモシャドウドメイン

CSDの形状はCDとよく似ている。3本のストランドからなるβシートを持つ球状ドメインであるが、αヘリックスは2本存在する[9]。CSDはin vitroでは容易にホモ二量体化し、その結果、PxVxLの特異的コンセンサス配列を有するHP1結合タンパク質を結合するための溝が形成される[8]。

作用機序

HP1αは主に遺伝子のサイレンシングをもたらす因子として機能し、その作用はCDとメチル化H3K9との相互作用に依存している[10]。CD上に存在するhydrophobic boxは、メチル化リジン残基の結合に適した環境を提供する。HP1αが遺伝子のサイレンシングをもたらす正確な機構は不明であるが、HP1はヘテロクロマチン領域でも迅速に交換されていることが実験的に示されている。このことは、ヘテロクロマチンはHP1が「糊」のように機能することで維持されているのではなく、むしろ多くの因子の動的な競合によってヘテロクロマチン構造と遺伝子の抑制、そしてユークロマチン構造と遺伝子の活性化が維持されていることを示唆している。H3K9がメチル化されている染色体領域ではHP1はより高濃度かつより静的となり、遺伝子が抑制されたヘテロクロマチン構造がもたらされる[9]。

進化的保存性

HP1αは進化的に保存されたタンパク質であり、分裂酵母Schizosaccharomyces pombeなどの種からヒトまで広く存在する[9]。ヒトとショウジョウバエのホモログの比較では、N末端のCDとC末端のCSDの保存性がより高く（50–70%のアミノ酸類似性）、ヒンジ領域は比較的低い（25–30%のアミノ酸類似性）[9]。

相互作用

CBX5（HP1α）は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000094916 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009575 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
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関連文献

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  • “Human homolog of Drosophila heterochromatin-associated protein 1 (HP1) is a DNA-binding protein which possesses a DNA-binding motif with weak similarity to that of human centromere protein C (CENP-C)”. Journal of Biochemistry 120 (1): 153–9. (Jul 1996). doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021378. PMID 8864858. 
  • “Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR”. The Journal of Biological Chemistry 272 (23): 14983–9. (Jun 1997). doi:10.1074/jbc.272.23.14983. PMID 9169472. 
  • “Stage-specific expression of polycomb group genes in human bone marrow cells”. Blood 91 (4): 1216–24. (Feb 1998). doi:10.1182/blood.V91.4.1216. PMID 9454751. 
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  • “Human Ku70 interacts with heterochromatin protein 1alpha”. The Journal of Biological Chemistry 276 (11): 8321–7. (Mar 2001). doi:10.1074/jbc.M008779200. PMID 11112778. 
  • “Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins”. Nature 410 (6824): 116–20. (Mar 2001). doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. 
  • “Selective recognition of methylated lysine 9 on histone H3 by the HP1 chromo domain”. Nature 410 (6824): 120–4. (Mar 2001). doi:10.1038/35065138. PMID 11242054. 
  • “Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins”. Molecular Cell 7 (4): 729–39. (Apr 2001). doi:10.1016/S1097-2765(01)00218-0. hdl:10261/308369. PMID 11336697. 
  • “INCENP is required for proper targeting of Survivin to the centromeres and the anaphase spindle during mitosis”. Current Biology 11 (11): 886–90. (Jun 2001). doi:10.1016/S0960-9822(01)00238-X. PMID 11516652. 
  • “The Ki-67 protein interacts with members of the heterochromatin protein 1 (HP1) family: a potential role in the regulation of higher-order chromatin structure”. The Journal of Pathology 196 (2): 135–44. (Feb 2002). doi:10.1002/path.1016. PMID 11793364. 
  • “Isolating human transcription factor targets by coupling chromatin immunoprecipitation and CpG island microarray analysis”. Genes & Development 16 (2): 235–44. (Jan 2002). doi:10.1101/gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC155318/. 
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関連項目

外部リンク

  • Human CBX5 genome location and CBX5 gene details page in the UCSC Genome Browser.