PYCARD

PYCARD
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1UCP, 2KN6, 3J63, 5H8O
Идентификаторы
Псевдонимы	PYCARD, ASC, CARD5, TMS, TMS-1, TMS1, PYD and CARD domain containing
Внешние ID	OMIM: 606838 MGI: 1931465 HomoloGene: 8307 GeneCards: PYCARD
Расположение гена (человек) Хр. 16-я хромосома человека[1] Локус 16p11.2 Начало 31,201,486 bp[1] Конец 31,203,450 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 7-я хромосома мыши[2] Локус 7|7 F3 Начало 127,588,880 bp[2] Конец 127,593,039 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в mucosa of transverse colon skin of leg skin of abdomen gingival epithelium Наибольшая экспрессия в migratory enteric neural crest cell crypt of lieberkuhn of small intestine epithelium of small intestine left colon Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция гомодимеризация белка interleukin-6 receptor binding BMP receptor binding связывание с белками плазмы связывание похожих белков enzyme binding cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Pyrin domain binding cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process myosin I binding tropomyosin binding protease binding transmembrane transporter binding protein dimerization activity cysteine-type endopeptidase activity Компонент клетки цитоплазма NLRP3 inflammasome complex NLRP1 inflammasome complex AIM2 inflammasome complex ядрышко эндоплазматический ретикулум митохондрия IkappaB kinase complex клеточное ядро secretory granule lumen azurophil granule lumen внеклеточная область цитозоль protein-containing complex neuronal cell body Golgi membrane аппарат Гольджи мембрана Биологический процесс positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity regulation of apoptotic process intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator positive regulation of adaptive immune response defense response to Gram-negative bacterium immune system process cellular response to tumor necrosis factor regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway positive regulation of DNA-binding transcription factor activity tumor necrosis factor-mediated signaling pathway positive regulation of JNK cascade negative regulation of interferon-beta production negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling myeloid dendritic cell activation positive regulation of T cell activation defense response to virus cellular response to interleukin-1 positive regulation of apoptotic process positive regulation of tumor necrosis factor production positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria negative regulation of protein serine/threonine kinase activity positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway воспалительная реакция cellular response to lipopolysaccharide negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity передача сигнала апоптоз врождённый иммунитет neutrophil degranulation positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity activation of innate immune response myeloid dendritic cell activation involved in immune response positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process positive regulation of actin filament polymerization regulation of protein stability positive regulation of interferon-gamma production positive regulation of interleukin-6 production positive regulation of activated T cell proliferation positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process macropinocytosis positive regulation of phagocytosis positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of T cell migration positive regulation of defense response to virus by host intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage response to bacterium regulation of autophagy interleukin-1 beta production regulation of GTPase activity regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process regulation of inflammatory response protein homooligomerization activation of cysteine-type endopeptidase activity negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response протеолиз positive regulation of interleukin-1 beta production Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 29108 66824 Ensembl ENSG00000103490 ENSMUSG00000030793 UniProt Q9ULZ3 Q9EPB4 RefSeq (мРНК) NM_145183 NM_013258 NM_145182 NM_023258 RefSeq (белок) NP_037390 NP_660183 NP_075747 Локус (UCSC) Chr 16: 31.2 – 31.2 Mb Chr 7: 127.59 – 127.59 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

PYCARD, или ASC (сокр. от англ. apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD, апоптоз-ассоциированный Speck-подобный белок, содержащий CARD) — цитозольный адаптерный белок. Продукт гена человека PYCARD.^[5]

Адаптерный белок включает два домена: N-концевой PYD домен и C-концевой CARD домен. Оба домена входят в большую группу т. н. доменов смерти, состоящих из 6 спиралей, которые опосредуют формирование крупных мультимолекулярных сигнальных комплексов, активирующих каспазу и играющих, таким образом, важную роль в воспалении и апоптозе. В клетках белок ASC находится в цитоплазме, но при активации апоптоза образует сферические белковые агрегаты вблизи клеточного ядра. Существуют две изоформы ASC.^[6]

PYCARD взаимодействует с белком MEFV.^[7]

• Инфламмасома
• NLRP3

• Masumoto J., Taniguchi S., Ayukawa K., et al. ASC, a novel 22-kDa protein, aggregates during apoptosis of human promyelocytic leukemia HL-60 cells. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 48. — P. 33835—33838. — doi:10.1074/jbc.274.48.33835. — PMID 10567338.
• Lee S. K., Na S. Y., Jung S. Y., et al. Activating protein-1, nuclear factor-kappaB, and serum response factor as novel target molecules of the cancer-amplified transcription coactivator ASC-2. (англ.) // Mol. Endocrinol.^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 6. — P. 915—925. — doi:10.1210/me.14.6.915. — PMID 10847592.
• Conway K. E., McConnell B. B., Bowring C. E., et al. TMS1, a novel proapoptotic caspase recruitment domain protein, is a target of methylation-induced gene silencing in human breast cancers. (англ.) // Cancer Research^[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2000. — Vol. 60, no. 22. — P. 6236—6242. — PMID 11103776.
• McConnell B. B., Vertino P. M. Activation of a caspase-9-mediated apoptotic pathway by subcellular redistribution of the novel caspase recruitment domain protein TMS1. (англ.) // Cancer Research^[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2000. — Vol. 60, no. 22. — P. 6243—6247. — PMID 11103777.
• Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 4. — P. R118—20. — doi:10.1016/S0960-9822(01)00056-2. — PMID 11250163.
• Geddes B. J., Wang L., Huang W. J., et al. Human CARD12 is a novel CED4/Apaf-1 family member that induces apoptosis. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 284, no. 1. — P. 77—82. — doi:10.1006/bbrc.2001.4928. — PMID 11374873.
• Richards N., Schaner P., Diaz A., et al. Interaction between pyrin and the apoptotic speck protein (ASC) modulates ASC-induced apoptosis. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 42. — P. 39320—39329. — doi:10.1074/jbc.M104730200. — PMID 11498534.
• Stimson K. M., Vertino P. M. Methylation-mediated silencing of TMS1/ASC is accompanied by histone hypoacetylation and CpG island-localized changes in chromatin architecture. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 7. — P. 4951—4958. — doi:10.1074/jbc.M109809200. — PMID 11733524.
• Manji G. A., Wang L., Geddes B. J., et al. PYPAF1, a PYRIN-containing Apaf1-like protein that assembles with ASC and regulates activation of NF-kappa B. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 13. — P. 11570—11575. — doi:10.1074/jbc.M112208200. — PMID 11786556.
• Srinivasula S. M., Poyet J. L., Razmara M., et al. The PYRIN-CARD protein ASC is an activating adaptor for caspase-1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 24. — P. 21119—21122. — doi:10.1074/jbc.C200179200. — PMID 11967258.
• Wang L., Manji G. A., Grenier J. M., et al. PYPAF7, a novel PYRIN-containing Apaf1-like protein that regulates activation of NF-kappa B and caspase-1-dependent cytokine processing. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 33. — P. 29874—29880. — doi:10.1074/jbc.M203915200. — PMID 12019269.
• Shiohara M., Taniguchi S., Masumoto J., et al. ASC, which is composed of a PYD and a CARD, is up-regulated by inflammation and apoptosis in human neutrophils. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 293, no. 5. — P. 1314—1318. — doi:10.1016/S0006-291X(02)00384-4. — PMID 12054656.
• Martinon F., Burns K., Tschopp J. The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. (англ.) // Mol. Cell^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 10, no. 2. — P. 417—426. — doi:10.1016/S1097-2765(02)00599-3. — PMID 12191486.
• Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• Stehlik C., Fiorentino L., Dorfleutner A., et al. The PAAD/PYRIN-family protein ASC is a dual regulator of a conserved step in nuclear factor kappaB activation pathways. (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2003. — Vol. 196, no. 12. — P. 1605—1615. — doi:10.1084/jem.20021552. — PMID 12486103. — PMC 2196065.
• Moriai R., Tsuji N., Kobayashi D., et al. A proapoptotic caspase recruitment domain protein gene, TMS1, is hypermethylated in human breast and gastric cancers. (англ.) // Anticancer Res.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 6C. — P. 4163—4168. — PMID 12553049.
• Dowds T. A., Masumoto J., Chen F. F., et al. Regulation of cryopyrin/Pypaf1 signaling by pyrin, the familial Mediterranean fever gene product. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 302, no. 3. — P. 575—580. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00221-3. — PMID 12615073.
• Masumoto J., Dowds T. A., Schaner P., et al. ASC is an activating adaptor for NF-kappa B and caspase-8-dependent apoptosis. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 303, no. 1. — P. 69—73. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00309-7. — PMID 12646168.
• Stehlik C., Krajewska M., Welsh K., et al. The PAAD/PYRIN-only protein POP1/ASC2 is a modulator of ASC-mediated nuclear-factor-kappa B and pro-caspase-1 regulation. (англ.) // Biochem. J.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 373, no. Pt 1. — P. 101—113. — doi:10.1042/BJ20030304. — PMID 12656673. — PMC 1223462.
• Levine J. J., Stimson-Crider K. M., Vertino P. M. Effects of methylation on expression of TMS1/ASC in human breast cancer cells. (англ.) // Oncogene^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 22. — P. 3475—3488. — doi:10.1038/sj.onc.1206430. — PMID 12776200.