FYVE domen
| FYVE cinkov prst | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Rani endozomni antigen 1 (EEA1), dimer sa lipidima.[1] | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | FYVE | ||||||||
| Pfam | PF01363 | ||||||||
| InterPro | IPR000306 | ||||||||
| PROSITE | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP | 1vfy | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1vfy | ||||||||
| OPM superfamilija | 62 | ||||||||
| OPM protein | 1vfy | ||||||||
| |||||||||
U molekularnoj biologiji FYVE cinkov prst domen je dobio ime po grupi od četiri proteina bogatih cisteinom: Fab 1 (kvaščani ortolog proteina PIKfyve), YOTB, Vac 1 (transportni protein vezikula), i EEA1, kod kojih je nađen. FYVE domeni vezuju fosfatidilinozitol 3-fosfat,[2] na način koji je zavistan od od koordinacije metalnih jona i od baznih aminokiselina. FYVE domen se umeće u ćelijske membrane na način koji je zavistan od pH vrednosti.[3] Ovaj domen učestvuje u vakuolarnom sortiranju proteina i funkcionisanju endozoma.[4]
Struktura
FYVE domen se sastoji od dve male beta ukosnice (ili cinkova zglavka) čemu sledi alfa heliks.[5] FYVE prst vezuje dva jona cinka. On ima osam pozicija koje potencijalno mogu da sadrže cink, i karakterističan je po tome što ima bazne aminokiseline oko cisteina. Mnogi članovi ove familije takođe sadrže dva histidina u motivu:
FYVE prst je strukturno sličan sa RING domenom i PHD prstom.
Primeri
Sledeći ljudski proteini sadrže FYVE domen:
- ANKFY1, EEA1 FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS MTMR3, MTMR4, PIKFYVE, PLEKHF1, PLEKHF2
- RUFY1, RUFY2, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE26, ZFYVE27, ZFYVE28, ZFYVE9
Reference
- ^ Dumas JJ; Merithew E; Sudharshan E; et al. (2001). „Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1”. Mol. Cell. 8 (5): 947—58. PMID 11741531. doi:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
- ^ Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (1998). „FYVE fingers bind PtdIns(3)P”. Nature. 394 (6692): 432—3. PMID 9697764. doi:10.1038/28767.
- ^ He J; Vora M; Haney RM; et al. (2009). „Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH”. Proteins. 76 (4): 852—60. PMC 2909462
. PMID 19296456. doi:10.1002/prot.22392. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза) - ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (1999). „Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage”. Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219—25. PMID 10209156. doi:10.1016/S0955-0674(99)80029-5.
- ^ Misra S, Hurley JH (1999). „Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p”. Cell. 97 (5): 657—66. PMID 10367894. doi:10.1016/S0092-8674(00)80776-X.
Literatura
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (1996). „Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger”. J. Biol. Chem. 271 (39): 24048—54. PMID 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (1999). „FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid”. J. Cell. Sci. 112 (Pt 23): 4175—83. PMID 10564636.
