EIF2AK4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1UKX, 4OTN | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF2AK4, GCN2, PVOD2, eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609280 MGI: 1353427 HomoloGene: 40891 GeneCards: EIF2AK4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
pulmonary capillary hemangiomatosis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • tRNA binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • RNA binding • ATP binding • eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Полісома • cytosolic ribosome |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of translational initiation in response to starvation • адаптивна імунна відповідь • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of long-term synaptic potentiation • positive regulation of adaptive immune response • negative regulation of translational initiation in response to stress • negative regulation of translational initiation • фосфорилювання • процес імунної системи • cellular response to UV • cellular response to amino acid starvation • negative regulation of CREB transcription factor activity • regulation of feeding behavior • навчення • нейробіологія розвитку • viral translation • neuron projection extension • protein phosphorylation • cellular response to cold • довготривала пам'ять • defense response to virus • cellular response to leucine starvation • eiF2alpha phosphorylation in response to endoplasmic reticulum stress • induction by virus of host autophagy • protein autophosphorylation • клітинний цикл • negative regulation by host of viral genome replication • GO:0022415 viral process • regulation of translation • regulation of translational initiation • positive regulation of defense response to virus by host • T cell activation involved in immune response • DNA damage checkpoint signaling • regulation of translational initiation by eIF2 alpha phosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001177806 NM_013719 NM_001355383 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001171277 NP_038747 NP_001342312 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 39.93 – 40.04 Mb | Хр. 2: 118.22 – 118.31 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF2AK4 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 649 амінокислот, а молекулярна маса — 186 911[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGGRGAPGR | | GRDEPPESYP | | QRQDHELQAL | | EAIYGADFQD | | LRPDACGPVK |
EPPEINLVLY | | PQGLTGEEVY | | VKVDLRVKCP | | PTYPDVVPEI | | ELKNAKGLSN |
ESVNLLKSRL | | EELAKKHCGE | | VMIFELAYHV | | QSFLSEHNKP | | PPKSFHEEML |
ERRAQEEQQR | | LLEAKRKEEQ | | EQREILHEIQ | | RRKEEIKEEK | | KRKEMAKQER |
LEIASLSNQD | | HTSKKDPGGH | | RTAAILHGGS | | PDFVGNGKHR | | ANSSGRSRRE |
RQYSVCNSED | | SPGSCEILYF | | NMGSPDQLMV | | HKGKCIGSDE | | QLGKLVYNAL |
ETATGGFVLL | | YEWVLQWQKK | | MGPFLTSQEK | | EKIDKCKKQI | | QGTETEFNSL |
VKLSHPNVVR | | YLAMNLKEQD | | DSIVVDILVE | | HISGVSLAAH | | LSHSGPIPVH |
QLRRYTAQLL | | SGLDYLHSNS | | VVHKVLSASN | | VLVDAEGTVK | | ITDYSISKRL |
ADICKEDVFE | | QTRVRFSDNA | | LPYKTGKKGD | | VWRLGLLLLS | | LSQGQECGEY |
PVTIPSDLPA | | DFQDFLKKCV | | CLDDKERWSP | | QQLLKHSFIN | | PQPKMPLVEQ |
SPEDSEGQDY | | VETVIPSNRL | | PSAAFFSETQ | | RQFSRYFIEF | | EELQLLGKGA |
FGAVIKVQNK | | LDGCCYAVKR | | IPINPASRQF | | RRIKGEVTLL | | SRLHHENIVR |
YYNAWIERHE | | RPAGPGTPPP | | DSGPLAKDDR | | AARGQPASDT | | DGLDSVEAAA |
PPPILSSSVE | | WSTSGERSAS | | ARFPATGPGS | | SDDEDDDEDE | | HGGVFSQSFL |
PASDSESDII | | FDNEDENSKS | | QNQDEDCNEK | | NGCHESEPSV | | TTEAVHYLYI |
QMEYCEKSTL | | RDTIDQGLYR | | DTVRLWRLFR | | EILDGLAYIH | | EKGMIHRDLK |
PVNIFLDSDD | | HVKIGDFGLA | | TDHLAFSADS | | KQDDQTGDLI | | KSDPSGHLTG |
MVGTALYVSP | | EVQGSTKSAY | | NQKVDLFSLG | | IIFFEMSYHP | | MVTASERIFV |
LNQLRDPTSP | | KFPEDFDDGE | | HAKQKSVISW | | LLNHDPAKRP | | TATELLKSEL |
LPPPQMEESE | | LHEVLHHTLT | | NVDGKAYRTM | | MAQIFSQRIS | | PAIDYTYDSD |
ILKGNFSIRT | | AKMQQHVCET | | IIRIFKRHGA | | VQLCTPLLLP | | RNRQIYEHNE |
AALFMDHSGM | | LVMLPFDLRI | | PFARYVARNN | | ILNLKRYCIE | | RVFRPRKLDR |
FHPKELLECA | | FDIVTSTTNS | | FLPTAEIIYT | | IYEIIQEFPA | | LQERNYSIYL |
NHTMLLKAIL | | LHCGIPEDKL | | SQVYIILYDA | | VTEKLTRREV | | EAKFCNLSLS |
SNSLCRLYKF | | IEQKGDLQDL | | MPTINSLIKQ | | KTGIAQLVKY | | GLKDLEEVVG |
LLKKLGIKLQ | | VLINLGLVYK | | VQQHNGIIFQ | | FVAFIKRRQR | | AVPEILAAGG |
RYDLLIPQFR | | GPQALGPVPT | | AIGVSIAIDK | | ISAAVLNMEE | | SVTISSCDLL |
VVSVGQMSMS | | RAINLTQKLW | | TAGITAEIMY | | DWSQSQEELQ | | EYCRHHEITY |
VALVSDKEGS | | HVKVKSFEKE | | RQTEKRVLET | | ELVDHVLQKL | | RTKVTDERNG |
REASDNLAVQ | | NLKGSFSNAS | | GLFEIHGATV | | VPIVSVLAPE | | KLSASTRRRY |
ETQVQTRLQT | | SLANLHQKSS | | EIEILAVDLP | | KETILQFLSL | | EWDADEQAFN |
TTVKQLLSRL | | PKQRYLKLVC | | DEIYNIKVEK | | KVSVLFLYSY | | RDDYYRILF |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, відповідь на стрес, клітинний цикл, нейрогенез, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- Berlanga J.J., Santoyo J., de Haro C. (1999). Characterization of a mammalian homolog of the GCN2 eukaryotic initiation factor 2alpha kinase. Eur. J. Biochem. 265: 754—762. PMID 10504407 DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00780.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF2AK4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19687 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P2K8 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |