IFNB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AU1

Ідентифікатори

Символи

IFNB1, IFB, IFF, IFNB, IFN-beta, interferon beta 1

Зовнішні ІД

OMIM: 147640 MGI: 107657 HomoloGene: 1640 GeneCards: IFNB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • GO:0005145 cytokine receptor binding • chloramphenicol O-acetyltransferase activity • type I interferon receptor binding
Клітинна компонента	• міжклітинний простір • extracellular region
Біологічний процес	• positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • зсідання крові • B cell differentiation • cellular response to interferon-beta • regulation of MHC class I biosynthetic process • negative regulation of viral genome replication • natural killer cell activation • B cell activation involved in immune response • positive regulation of apoptotic signaling pathway • cell surface receptor signaling pathway • natural killer cell activation involved in immune response • response to exogenous dsRNA • response to virus • T cell activation involved in immune response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • defense response • negative regulation of T cell differentiation • positive regulation of innate immune response • cellular response to exogenous dsRNA • negative regulation of T-helper 2 cell cytokine production • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • regulation of signaling receptor activity • humoral immune response • B cell proliferation • адаптивна імунна відповідь • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3456


15977

Ensembl


ENSG00000171855


ENSMUSG00000048806

UniProt


P01574


P01575

RefSeq (мРНК)


NM_002176


NM_010510

RefSeq (білок)


NP_002167


NP_034640

Локус (UCSC)

Хр. 9: 21.08 – 21.08 Mb

Хр. 4: 88.44 – 88.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFNB1 (англ. Interferon beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 187 амінокислот, а молекулярна маса — 22 294^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTNKCLLQIA	LLLCFSTTAL	SMSYNLLGFL	QRSSNFQCQK	LLWQLNGRLE
YCLKDRMNFD	IPEEIKQLQQ	FQKEDAALTI	YEMLQNIFAI	FRQDSSSTGW
NETIVENLLA	NVYHQINHLK	TVLEEKLEKE	DFTRGKLMSS	LHLKRYYGRI
LHYLKAKEYS	HCAWTIVRVE	ILRNFYFINR	LTGYLRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

Ohno S., Taniguchi T. (1981). Structure of a chromosomal gene for human interferon beta. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 78: 5305—5309. PMID 16593086 DOI:10.1073/pnas.78.9.5305
Taniguchi T., Ohno S., Fujii-Kuriyama Y., Muramatsu M. (1980). The nucleotide sequence of human fibroblast interferon cDNA. Gene. 10: 11—15. PMID 6157601 DOI:10.1016/0378-1119(80)90138-9
May L.T., Sehgal P.B. (1985). On the relationship between human interferon alpha 1 and beta 1 genes. J. Interferon Res. 5: 521—526. PMID 2414376 DOI:10.1089/jir.1985.5.521
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wetzel R. (1981). Assignment of the disulphide bonds of leukocyte interferon. Nature. 289: 606—607. PMID 6162107 DOI:10.1038/289606a0
Shepard H.M., Leung D., Stebbing N., Goeddel D.V. (1981). A single amino acid change in IFN-beta1 abolishes its antiviral activity. Nature. 294: 563—565. PMID 6171735 DOI:10.1038/294563a0

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5434 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P01574 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.