PPBP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1TVX, 1F9P, 1NAP

Ідентифікатори

Символи

PPBP, B-TG1, Beta-TG, CTAP-III, CTAP3, CTAPIII, CXCL7, LA-PF4, LDGF, MDGF, NAP-2, PBP, SCYB7, TC1, TC2, TGB, TGB1, THBGB, THBGB1, pro-platelet basic protein

Зовнішні ІД

OMIM: 121010 MGI: 1888712 HomoloGene: 136759 GeneCards: PPBP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity • cytokine activity • glucose transmembrane transporter activity • CXCR chemokine receptor binding • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• platelet alpha granule lumen • extracellular region • міжклітинний простір • tertiary granule lumen • platelet alpha granule
Біологічний процес	• response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • хемотаксис • positive regulation of cell division • platelet degranulation • defense response to bacterium • inflammatory response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • chemokine-mediated signaling pathway • defense response • positive regulation of neutrophil chemotaxis • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • neutrophil degranulation • cell chemotaxis • G protein-coupled receptor signaling pathway • glucose transmembrane transport • neutrophil chemotaxis • leukocyte chemotaxis • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5473


57349

Ensembl


ENSG00000163736


ENSMUSG00000029372

UniProt


P02775


Q9EQI5

RefSeq (мРНК)


NM_002704


NM_023785

RefSeq (білок)


NP_002695


NP_076274

Локус (UCSC)

Хр. 4: 73.99 – 73.99 Mb

Хр. 5: 90.92 – 90.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPBP (англ. Pro-platelet basic protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 894^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLRLDTTPS	CNSARPLHAL	QVLLLLSLLL	TALASSTKGQ	TKRNLAKGKE
ESLDSDLYAE	LRCMCIKTTS	GIHPKNIQSL	EVIGKGTHCN	QVEVIATLKD
GRKICLDPDA	PRIKKIVQKK	LAGDESAD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту, антибіотиків, антимікробних білків, мітогенів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Castor C.W., Miller J.W., Walz D.A. (1983). Structural and biological characteristics of connective tissue activating peptide (CTAP-III), a major human platelet-derived growth factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 765—769. PMID 6572368 DOI:10.1073/pnas.80.3.765
Begg G.S., Pepper D.S., Chesterman C.N., Morgan F.J. (1978). Complete covalent structure of human beta-thromboglobulin. Biochemistry. 17: 1739—1744. PMID 77677 DOI:10.1021/bi00602a024
Walz A., Baggiolini M. (1989). A novel cleavage product of beta-thromboglobulin formed in cultures of stimulated mononuclear cells activates human neutrophils. Biochem. Biophys. Res. Commun. 159: 969—975. PMID 2522778 DOI:10.1016/0006-291X(89)92203-1
Walz A., Baggiolini M. (1990). Generation of the neutrophil-activating peptide NAP-2 from platelet basic protein or connective tissue-activating peptide III through monocyte proteases. J. Exp. Med. 171: 449—454. PMID 2406364 DOI:10.1084/jem.171.2.449

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9240 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P02775 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.