SNAI1

SNAI1
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2Y48, 3W5K, 4QLI
Identifiants
Aliases	SNAI1
IDs externes	OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 20 humain[1] Locus 20q13.13 Début 49,982,980 bp[1] Fin 49,988,886 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 2 (souris)[2] Locus 2 H3|2 87.33 cM Début 167,380,115 bp[2] Fin 167,384,734 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans vésicule biliaire left uterine tube right lobe of thyroid gland left lobe of thyroid gland aorte ascendante upper lobe of left lung poumon droit artère coronaire gauche artère coronaire droite right adrenal gland Fortement exprimé dans Crête neurale mésoderme calvaria placenta Sclérotome morula maxillary prominence allantoïde tracheobronchial tree derme Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire sequence-specific DNA binding liaison ADN RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding liaison ion métal liaison de kinase liaison protéique DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific Fixation d'acide nucléique DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific E-box binding Composant cellulaire noyau cytoplasme nucléoplasme pericentric heterochromatin cytosol Processus biologique trophoblast giant cell differentiation roof of mouth development regulation of bicellular tight junction assembly positive regulation of cell migration regulation of transcription by RNA polymerase II epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage développent d'un organisme multicellulaire negative regulation of vitamin D biosynthetic process régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator osteoblast differentiation negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development cartilage morphogenesis hair follicle morphogenesis left/right pattern formation mesoderm development negative regulation of transcription, DNA-templated migration cellulaire negative regulation of transcription by RNA polymerase II Notch signaling involved in heart development mesoderm formation Transition épithélio-mésenchymateuse positive regulation of epithelial to mesenchymal transition heterochromatin organization aortic valve morphogenesis Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 6615 20613 Ensembl ENSG00000124216 ENSMUSG00000042821 UniProt O95863 Q02085 RefSeq (mRNA) NM_005985 NM_011427 RefSeq (protéine) NP_005976 NP_035557 Localisation (UCSC) Chr 20: 49.98 – 49.99 Mb Chr 2: 167.38 – 167.38 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Le SNAI1 (appelé aussi snail ou snail1) est un facteur de transcription à doigt de zinc. Son gène est le SNAI1 situé sur le chromosome 20 humain.

Rôles

Il réprime l'expression des claudines et des occludines intervenant dans les jonctions serrées au niveau de la transition épithélium-mésenchyme^[5], ce qui constitue une autre voie d'action que celle de la cadhérine E ^[6].

En médecine

Plusieurs germes permettent l'activation de cette protéine entraînant une perméabilité de la barrière hémato-encéphalique^[7].

Notes et références

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