KCND1

Ідентифікатори

Символи

KCND1, KV4.1, potassium voltage-gated channel subfamily D member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 300281 MGI: 96671 HomoloGene: 21035 GeneCards: KCND1

Реагує на сполуку

дальфампридин, tetraethylammonium^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • A-type (transient outward) potassium channel activity • voltage-gated potassium channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell projection • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • компонент клітини
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • protein homooligomerization • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3750


16506

Ensembl


ENSG00000102057


ENSMUSG00000009731

UniProt


Q9NSA2


Q03719

RefSeq (мРНК)


NM_004979


NM_008423

RefSeq (білок)


NP_004970


NP_032449

Локус (UCSC)

Хр. X: 48.96 – 48.97 Mb

Хр. X: 7.69 – 7.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCND1 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 647 амінокислот, а молекулярна маса — 71 330^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGLATWLP	FARAAAVGWL	PLAQQPLPPA	PGVKASRGDE	VLVVNVSGRR
FETWKNTLDR	YPDTLLGSSE	KEFFYDADSG	EYFFDRDPDM	FRHVLNFYRT
GRLHCPRQEC	IQAFDEELAF	YGLVPELVGD	CCLEEYRDRK	KENAERLAED
EEAEQAGDGP	ALPAGSSLRQ	RLWRAFENPH	TSTAALVFYY	VTGFFIAVSV
IANVVETIPC	RGSARRSSRE	QPCGERFPQA	FFCMDTACVL	IFTGEYLLRL
FAAPSRCRFL	RSVMSLIDVV	AILPYYIGLL	VPKNDDVSGA	FVTLRVFRVF
RIFKFSRHSQ	GLRILGYTLK	SCASELGFLL	FSLTMAIIIF	ATVMFYAEKG
TNKTNFTSIP	AAFWYTIVTM	TTLGYGDMVP	STIAGKIFGS	ICSLSGVLVI
ALPVPVIVSN	FSRIYHQNQR	ADKRRAQQKV	RLARIRLAKS	GTTNAFLQYK
QNGGLEDSGS	GEEQALCVRN	RSAFEQQHHH	LLHCLEKTTC	HEFTDELTFS
EALGAVSPGG	RTSRSTSVSS	QPVGPGSLLS	SCCPRRAKRR	AIRLANSTAS
VSRGSMQELD	MLAGLRRSHA	PQSRSSLNAK	PHDSLDLNCD	SRDFVAAIIS
IPTPPANTPD	ESQPSSPGGG	GRAGSTLRNS	SLGTPCLFPE	TVKISSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, калію. Локалізований у мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jerng H.H., Qian Y., Pfaffinger P.J. (2004). Modulation of Kv4.2 channel expression and gating by dipeptidyl peptidase 10 (DPP10). Biophys. J. 87: 2380—2396. PMID 15454437 DOI:10.1529/biophysj.104.042358

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6237 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NSA2 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані