CD109

CD109
Идентификаторы
ПсевдонимыCD109, CPAMD7, p180, r150, CD109 molecule
Внешние IDOMIM: 608859 MGI: 2445221 HomoloGene: 25183 GeneCards: CD109
Расположение гена (человек)
6-я хромосома человека
Хр.6-я хромосома человека[1]
6-я хромосома человека
Расположение в геноме CD109
Расположение в геноме CD109
Локус6q13Начало73,695,785 bp[1]
Конец73,828,316 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD109
Расположение в геноме CD109
Локус9|9 E1Начало78,522,828 bp[2]
Конец78,623,535 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • skin of arm

  • skin of thigh

  • skin of hip

  • tendon of biceps brachii
Наибольшая экспрессия в
  • body of femur

  • skin of back
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • peptidase inhibitor activity
  • endopeptidase inhibitor activity
  • transforming growth factor beta binding
  • serine-type endopeptidase inhibitor activity
Компонент клетки
  • поверхность клетки
  • anchored component of membrane
  • мембрана
  • внеклеточная область
  • внеклеточное пространство
  • клеточная мембрана
  • platelet alpha granule membrane
Биологический процесс
  • hair follicle development
  • negative regulation of protein phosphorylation
  • regulation of keratinocyte differentiation
  • osteoclast fusion
  • negative regulation of wound healing
  • negative regulation of peptidase activity
  • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
  • negative regulation of keratinocyte proliferation
  • negative regulation of endopeptidase activity
  • platelet degranulation
  • C-terminal protein lipidation
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

135228

235505

Ensembl

ENSG00000156535

ENSMUSG00000046186

UniProt

Q6YHK3

Q8R422

RefSeq (мРНК)

NM_001159587
NM_001159588
NM_133493

NM_153098

RefSeq (белок)

NP_001153059
NP_001153060
NP_598000

NP_694738

Локус (UCSC)Chr 6: 73.7 – 73.83 MbChr 9: 78.52 – 78.62 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CD109 — белок, GPI-заякоренный на поверхности клеток. Продукт гена CD109[5].

Функция

Белок CD109 является отрицательным модулятором TGFB1 в кератиноцитах.

Тканевая локализация

Высокий уровень белка находится в матке, аорте, сердце, лёгких, трахее, плаценте и в фетальных сердце, почках, печени, селезёнке и лёгких. Белок экспрессируют T-лимфоциты, активированные T-лимфобласты, эндотелиальные клетки и активированные тромбоциты, а также CD34+-клетки клеточной линии острого миелоидного лейкоза. Кроме этого, CD109 — носитель тромбоцитарной антигенной системы Gov, которая играет роль в отторжении при трансфузии тромбоцитов, в неонатальной аллоиммунной тромбоцитопении и пост-трансфузионной пурпуры.[5]

Структура и взаимодействия

CD86 синтезируется как предшественник из 1445 аминокислот, после созревания и отщепления сигнального пептида и пропептида остаётся 1399 аминокислот (180 кДа). После пост-трансляционной модификации (гликозилирования) и частичного протеолиза образуется две изоформы: 150 и 120 кДа. Образует гетеродимеры с TGFBR1, TGFBR2 и TGFBR3.

Взаимодействует с TGFB1 и TGFBR1.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000156535 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046186 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 Entrez Gene: CD109 CD109 molecule  (неопр.).

Литература

  • Lucas G.F., Metcalfe P. Platelet and granulocyte glycoprotein polymorphisms. (англ.) // Transfusion medicine (Oxford, England) : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 3. — P. 157—174. — doi:10.1046/j.1365-3148.2000.00250.x. — PMID 10972910.
  • Sutherland D.R., Yeo E., Ryan A. et al. Identification of a cell-surface antigen associated with activated T lymphoblasts and activated platelets. (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1991. — Vol. 77, no. 1. — P. 84—93. — PMID 1984805.
  • Kelton J.G., Smith J.W., Horsewood P. et al. Gova/b alloantigen system on human platelets. (англ.) // Blood[англ.]. — American Society of Hematology[англ.], 1990. — Vol. 75, no. 11. — P. 2172—2176. — PMID 2346781.
  • Lin M., Sutherland D.R., Horsfall W. et al. Cell surface antigen CD109 is a novel member of the alpha(2) macroglobulin/C3, C4, C5 family of thioester-containing proteins. (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 5. — P. 1683—1691. — doi:10.1182/blood.V99.5.1683. — PMID 11861284.
  • Schuh A.C., Watkins N.A., Nguyen Q. et al. A tyrosine703serine polymorphism of CD109 defines the Gov platelet alloantigens. (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 5. — P. 1692—1698. — doi:10.1182/blood.V99.5.1692. — PMID 11861285.
  • Giesert C., Marxer A., Sutherland D.R. et al. Antibody W7C5 defines a CD109 epitope expressed on CD34+ and CD34- hematopoietic and mesenchymal stem cell subsets. (англ.) // Ann. N. Y. Acad. Sci.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 996. — P. 227—230. — doi:10.1111/j.1749-6632.2003.tb03250.x. — PMID 12799300.
  • Mungall A.J., Palmer S.A., Sims S.K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6. (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Solomon K.R., Sharma P., Chan M. et al. CD109 represents a novel branch of the alpha2-macroglobulin/complement gene family. (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 2004. — Vol. 327, no. 2. — P. 171—183. — doi:10.1016/j.gene.2003.11.025. — PMID 14980714.
  • Zhang J.M., Hashimoto M., Kawai K. et al. CD109 expression in squamous cell carcinoma of the uterine cervix. (англ.) // Pathol. Int. : journal. — 2005. — Vol. 55, no. 4. — P. 165—169. — doi:10.1111/j.1440-1827.2005.01807.x. — PMID 15826242.
  • Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 5, no. 2. — P. 226—233. — doi:10.1074/mcp.M500324-MCP200. — PMID 16263699.
  • Liu T., Qian W.J., Gritsenko M.A. et al. Human Plasma N-Glycoproteome Analysis by Immunoaffinity Subtraction, Hydrazide Chemistry, and Mass Spectrometry (англ.) // J. Proteome Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 6. — P. 2070—2080. — doi:10.1021/pr0502065. — PMID 16335952. — PMC 1850943.
  • Finnson K.W., Tam B.Y., Liu K. et al. Identification of CD109 as part of the TGF-beta receptor system in human keratinocytes (англ.) // The FASEB Journal[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology[англ.], 2006. — Vol. 20, no. 9. — P. 1525—1527. — doi:10.1096/fj.05-5229fje. — PMID 16754747.
  • Sjöblom T., Jones S., Wood L.D. et al. The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 314, no. 5797. — P. 268—274. — doi:10.1126/science.1133427. — PMID 16959974.
  • Hasegawa M., Hagiwara S., Sato T. et al. CD109, a new marker for myoepithelial cells of mammary, salivary, and lacrimal glands and prostate basal cells (англ.) // Pathol. Int. : journal. — 2007. — Vol. 57, no. 5. — P. 245—250. — doi:10.1111/j.1440-1827.2007.02097.x. — PMID 17493171.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400